Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTBP60709 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ACTBP60709 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ACTBP60709 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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