Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFRD-1P60508 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms