Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIK1P57059 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK1P57059 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK1P57059 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK1P57059 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK1P57059 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK1P57059 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK1P57059 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK1P57059 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK1P57059 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIK1P57059 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIK1P57059 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIK1P57059 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK1P57059 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK1P57059 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK1P57059 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK1P57059 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK1P57059 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK1P57059 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK1P57059 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK1P57059 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIK1P57059 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIK1P57059 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms