Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BACE1P56817 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BACE1P56817 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BACE1P56817 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BACE1P56817 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BACE1P56817 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BACE1P56817 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BACE1P56817 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BACE1P56817 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BACE1P56817 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BACE1P56817 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BACE1P56817 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BACE1P56817 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BACE1P56817 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BACE1P56817 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms