Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAPAP54920 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAPAP54920 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NAPAP54920 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAPAP54920 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAPAP54920 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAPAP54920 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAPAP54920 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAPAP54920 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAPAP54920 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAPAP54920 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAPAP54920 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NAPAP54920 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NAPAP54920 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NAPAP54920 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NAPAP54920 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NAPAP54920 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPAP54920 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPAP54920 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPAP54920 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPAP54920 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPAP54920 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPAP54920 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPAP54920 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPAP54920 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPAP54920 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPAP54920 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPAP54920 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPAP54920 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NAPAP54920 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAPAP54920 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAPAP54920 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAPAP54920 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAPAP54920 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAPAP54920 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NAPAP54920 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms