Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP1B3P54709 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms