Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARSP54136 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARSP54136 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARSP54136 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARSP54136 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARSP54136 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARSP54136 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARSP54136 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARSP54136 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARSP54136 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RARSP54136 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RARSP54136 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARSP54136 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARSP54136 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARSP54136 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RARSP54136 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
RARSP54136 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RARSP54136 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARSP54136 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARSP54136 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARSP54136 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARSP54136 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARSP54136 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARSP54136 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARSP54136 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARSP54136 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARSP54136 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARSP54136 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARSP54136 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARSP54136 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARSP54136 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARSP54136 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARSP54136 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARSP54136 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARSP54136 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARSP54136 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RARSP54136 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARSP54136 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARSP54136 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARSP54136 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARSP54136 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARSP54136 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARSP54136 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARSP54136 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARSP54136 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARSP54136 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARSP54136 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms