Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP3M2P53677 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP3M2P53677 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M2P53677 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M2P53677 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M2P53677 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M2P53677 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M2P53677 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M2P53677 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M2P53677 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M2P53677 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M2P53677 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AP3M2P53677 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M2P53677 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AP3M2P53677 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3M2P53677 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms