Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLTCL1P53675 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLTCL1P53675 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms