Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COPAP53621 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COPAP53621 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COPAP53621 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COPAP53621 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
COPAP53621 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms