Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POU3F4P49335 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms