Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSN1S1P47710 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSN1S1P47710 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms