Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCAP37840 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCAP37840 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNCAP37840 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNCAP37840 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNCAP37840 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNCAP37840 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCAP37840 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCAP37840 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms