Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCND2P30279 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCND2P30279 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCND2P30279 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCND2P30279 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCND2P30279 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND2P30279 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND2P30279 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND2P30279 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND2P30279 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND2P30279 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND2P30279 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND2P30279 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND2P30279 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND2P30279 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCND2P30279 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCND2P30279 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCND2P30279 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND2P30279 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND2P30279 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND2P30279 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND2P30279 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND2P30279 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND2P30279 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND2P30279 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND2P30279 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND2P30279 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND2P30279 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND2P30279 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND2P30279 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCND2P30279 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms