Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTKP29376 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTKP29376 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTKP29376 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTKP29376 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTKP29376 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTKP29376 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTKP29376 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTKP29376 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTKP29376 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTKP29376 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTKP29376 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTKP29376 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTKP29376 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTKP29376 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTKP29376 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTKP29376 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTKP29376 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTKP29376 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTKP29376 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTKP29376 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTKP29376 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTKP29376 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTKP29376 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTKP29376 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LTKP29376 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LTKP29376 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LTKP29376 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTKP29376 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LTKP29376 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LTKP29376 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTKP29376 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTKP29376 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LTKP29376 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LTKP29376 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTKP29376 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTKP29376 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LTKP29376 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTKP29376 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTKP29376 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTKP29376 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTKP29376 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTKP29376 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LTKP29376 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LTKP29376 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTKP29376 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTKP29376 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTKP29376 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTKP29376 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LTKP29376 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTKP29376 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTKP29376 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTKP29376 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LTKP29376 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms