Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5AP29375 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5AP29375 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5AP29375 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5AP29375 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5AP29375 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5AP29375 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5AP29375 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5AP29375 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5AP29375 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KDM5AP29375 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms