Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTGFP29279 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTGFP29279 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTGFP29279 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTGFP29279 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTGFP29279 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTGFP29279 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTGFP29279 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTGFP29279 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTGFP29279 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTGFP29279 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTGFP29279 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTGFP29279 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTGFP29279 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTGFP29279 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTGFP29279 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTGFP29279 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTGFP29279 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTGFP29279 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTGFP29279 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTGFP29279 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTGFP29279 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTGFP29279 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTGFP29279 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTGFP29279 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTGFP29279 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTGFP29279 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTGFP29279 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms