Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD34P28906 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD34P28906 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD34P28906 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CD34P28906 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CD34P28906 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CD34P28906 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms