Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLD1P28340 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLD1P28340 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLD1P28340 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLD1P28340 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLD1P28340 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLD1P28340 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms