Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL3RAP26951 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IL3RAP26951 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms