Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
TRIM21P19474 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRIM21P19474 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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