Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NCLP19338 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCLP19338 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCLP19338 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCLP19338 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NCLP19338 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCLP19338 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCLP19338 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCLP19338 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCLP19338 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCLP19338 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCLP19338 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms