Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PRG2P13727 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PRG2P13727 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRG2P13727 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRG2P13727 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRG2P13727 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms