Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD8P13378 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXD8P13378 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms