Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
COX6A1P12074 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COX6A1P12074 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms