Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYH3P11055 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYH3P11055 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYH3P11055 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYH3P11055 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYH3P11055 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYH3P11055 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYH3P11055 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH3P11055 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH3P11055 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH3P11055 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH3P11055 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH3P11055 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH3P11055 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH3P11055 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH3P11055 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH3P11055 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH3P11055 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH3P11055 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYH3P11055 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYH3P11055 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MYH3P11055 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MYH3P11055 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYH3P11055 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH3P11055 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH3P11055 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH3P11055 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH3P11055 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH3P11055 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH3P11055 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH3P11055 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH3P11055 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYH3P11055 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms