Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC192P0DO97 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC192P0DO97 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms