Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SAA2P0DJI9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms