Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RD3LP0DJH9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms