Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLR3DP05423 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms