Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IFNA4P05014 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms