Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-17P01599 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms