Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOSP01100 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOSP01100 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOSP01100 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOSP01100 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FOSP01100 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOSP01100 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOSP01100 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSP01100 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSP01100 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSP01100 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOSP01100 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms