Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINC1P01008 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms