Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD4O95243 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD4O95243 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD4O95243 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD4O95243 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MBD4O95243 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MBD4O95243 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MBD4O95243 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MBD4O95243 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MBD4O95243 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MBD4O95243 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms