Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL3O95236 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL3O95236 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL3O95236 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL3O95236 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL3O95236 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL3O95236 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL3O95236 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL3O95236 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL3O95236 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL3O95236 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL3O95236 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOL3O95236 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL3O95236 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL3O95236 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL3O95236 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL3O95236 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL3O95236 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL3O95236 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL3O95236 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL3O95236 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL3O95236 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL3O95236 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL3O95236 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL3O95236 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOL3O95236 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms