Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCATO75600 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCATO75600 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCATO75600 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCATO75600 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCATO75600 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCATO75600 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCATO75600 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCATO75600 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCATO75600 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GCATO75600 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GCATO75600 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GCATO75600 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GCATO75600 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GCATO75600 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GCATO75600 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GCATO75600 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GCATO75600 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms