Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA10O75578 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms