Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VAMP4O75379 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VAMP4O75379 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms