Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA3O75145 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA3O75145 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms