Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SYNCRIPO60506 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms