Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SOX15O60248 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SOX15O60248 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SOX15O60248 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SOX15O60248 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SOX15O60248 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOX15O60248 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms