Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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PDE6DO43924 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PDE6DO43924 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PDE6DO43924 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PDE6DO43924 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PDE6DO43924 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PDE6DO43924 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PDE6DO43924 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PDE6DO43924 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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PDE6DO43924 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PDE6DO43924 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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