Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNQ3O43525 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KCNQ3O43525 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms