Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MAP3K13O43283 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MAP3K13O43283 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms