Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CLOCKO15516 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CLOCKO15516 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms