Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN2DO15399 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN2DO15399 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms