Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms