Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCER2I3L3R5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms