Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
E9PCH4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
E9PCH4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
E9PCH4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E9PCH4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
E9PCH4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
E9PCH4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
E9PCH4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
E9PCH4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
E9PCH4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
E9PCH4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
E9PCH4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
E9PCH4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
E9PCH4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
E9PCH4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
E9PCH4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
E9PCH4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
E9PCH4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms